Objetivos.

Este estudio tiene los siguientes objetivos principales

Identificar

Marcadores genéticos de susceptibilidad y pronóstico de la infección por COVID-19

Identificar

Firmas transcriptómicas locales y sistémicas que permitan el diagnóstico diferencial preciso de la infección por COVID-19 en diferentes momentos de la infección así como establecer marcadores pronósticos de su historia natural.

Estudio

Diferencial de los patrones de expresión en diferentes muestras del huésped

Identificar

Biomarcadores solubles relacionados con el sistema inmune que permitan caracterizar y predecir la respuesta inmune a COVID19

Estudio

De los patrones proteómicos en muestras de distinta naturaleza del huésped y en distintos estadíos de la infección

Estudio

De la variabilidad genética del patógeno

Análisis

Análisis multiómico de eventos adversos de vacunas (adversomics) y fallos de vacunas

Integración nacional e internacional
GEN-COVID.

A nivel nacional

GEN-COVID recibirá muestras para estudios genéticos de la red GENDRES, del proyecto multicéntrico nacional EPICAL (coordinado por el Dr. Tarrago, Hospital 12 de Octubre) y del proyecto multicéntrico nacional GESNEO-COVID (coordinado por la Dra. Marisa Navarro, Hospital Gregorio Marañon).

A nivel internacional

Estamos trabajando como parte de la Iniciativa COVID-19 Host Genetics en proyectos de genotipado de alto rendimiento y secuenciación paralela masiva para investigar los factores genéticos del huésped que influyen en la susceptibilidad de COVID-19.

GEN-COVID tiene colaboración cruzada con otros consorcios internacionales relacionados con el COVID-19 y cuya coordinación clínica se realiza desde el Servizo Galego de Saude (SERGAS) a través del Servicio de Pediatría del Hospital Clínico Universitario de Santiago, fundamentalmente a través de macroproyectos de finaciación europea centrados en el estudio de las infecciones desde la perceptiva del huésped, en concreto mediante la aplicación de genómica, transcriptómica y proteómica en la búsqueda de biomarcadores diagnósticos.

  1. PROYECTO EUROPEO H2020 PERFORM (Grant Agreement 668303).

  2. PROYECTO EUROPEO H2020 DIAMONDS (Grant Agreement 848196).

  3. PROYECTO EUROPEO FP7 PREPARE (Grant Agreement 602525).

Publicaciones.

A Strategy Targeting Monocyte-Macrophage Differentiation to Avoid Pulmonary Complications in SARS-Cov2 Infection

J Gómez-Rial 1, F Martinón-Torres 2

Clin Immunol. 2020 Jul;216:108442. doi: 10.1016/j.clim.2020.108442. Epub 2020 Apr 23.

PMID: 32335290 PMCID: PMC7194539 DOI: 10.1016/j.clim.2020.108442

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Increased Serum Levels of sCD14 and sCD163 Indicate a Preponderant Role for Monocytes in COVID-19 Immunopathology

Jose Gómez-Rial, Maria José Currás-Tuala, Irene Rivero-Calle, Alberto Gómez-Carballa, Miriam Cebey-López, Carmen Rodríguez-Tenreiro, Ana Dacosta-Urbieta, Carmen Rivero-Velasco, Nuria Rodríguez-Núñez, Rocio Trastoy-Pena, Javier Rodríguez-García, Antonio Salas, and Federico Martinón-Torres

Front Immunol. 2020 Sep 23;11:560381. doi: 10.3389/fimmu.2020.560381. eCollection 2020

PMID: 33072099 PMCID: PMC7538662 DOI: 10.3389/fimmu.2020.560381

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Seroprevalence of SARS-CoV-2 among pediatric healthcare workers in Spain

A Dacosta Urbieta, I Rivero Calle, J Pardo Seco, L Redondo Collazo, A Salas J Gómez Rial and F Martinón Torres

Front Pediatr. 2020 Sep 11;8:547. doi: 10.3389/fped.2020.00547. eCollection 2020.

PMID: 33042908 PMCID: PMC7516980 DOI: 10.3389/fped.2020.00547

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Role of Monocytes/Macrophages in Covid-19 Pathogenesis: Implications for Therapy

Gómez-Rial J, Rivero-Calle I, Salas A, Martinón-Torres F

Infect Drug Resist . 2020 Jul 22;13:2485-2493. doi: 10.2147/IDR.S258639. eCollection 2020

PMID: 32801787 PMCID: PMC7383015 DOI: 10.2147/IDR.S258639

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Mapping genome variation of SARS-CoV-2 worldwide highlights the impact of COVID-19 super-spreaders

Alberto Gomez-Carballa, Xabi Bello, Jacobo Pardo-Seco, Federico Martinon-Torres and Antonio Salas

Genome Res. 2020 Oct;30(10):1434-1448. doi: 10.1101/gr.266221.120. Epub 2020 Sep 2.

PMID: 32878977 PMCID: PMC7605265 (available on 2021-04-01) DOI: 10.1101/gr.266221.120

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Phylogeography of SARS-CoV-2 pandemic in Spain: a story of multiple introductions, micro-geographic stratification, founder effects, and super-spreaders

Alberto Gómez-Carballa, Xabier Bello, Jacobo Pardo-Seco, María Luisa Pérez Del Molino Federico Martinón-Torres, Antonio Salas

Zool Res. 2020 Nov 18;41(6):605-620. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2020.217.

PMID: 32935498 PMCID: PMC7671907 DOI: 10.24272/j.issn.2095-8137.2020.217

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Pitfalls of barcodes in the study of worldwide SARS-CoV-2 variation and phylodynamics.

Pardo-Seco J, Gómez-Carballa A, Bello X, Martinón-Torres F, Salas A.

Zool Res. 2021 Jan 18;42(1):87-93. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2020.364.

PMID: 33410308.

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Phylogenetic analysis of SARS-CoV-2 in Boston highlights the impact of superspreading events

Salas A, Bello X, Pardo-Seco J, Martinón-Torres F, Gómez-Carballa

A (2021) Superspreading: The engine of the SARS-CoV-2 pandemic. Science, eLetter;

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A multi-tissue study of immune gene expression profiling highlights the key role of the nasal epithelium in COVID-19 severity

Alberto Gómez-Carballa , Irene Rivero-Calle, Jacobo Pardo-Seco, José Gómez-Rial, Carmen Rivero-Velasco, Nuria Rodríguez-Núñez, Gema Barbeito-Castiñeiras, Hugo Pérez-Freixo, Miriam Cebey-López, Ruth Barral-Arca, Carmen Rodriguez-Tenreiro, Ana Dacosta-Urbieta, Xabier Bello, Sara Pischedda, María José Currás-Tuala, Sandra Viz-Lasheras, Federico Martinón-Torres, Antonio Salas, GEN-COVID study group

Environ Res. 2022 Feb 22;210:112890. doi: 10.1016/j.envres.2022.112890

PMID: 35202626  PMCID: PMC8861187  DOI: 10.1016/j.envres.2022.112890

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Logros.

Proyecto concedido por la entidad GAIN: Axencia Galega de

Evaluación de la influencia de los factores genéticos del huésped en la susceptibilidad, patogenia, diagnóstico y pronóstico en la infección por SARS-COV-2 (GEN-COVID)

InnovaciónProyectos GaIN Rescata-Covid_IN845D 2020/23

Research team.

Federico Martinón Torres

Investigador Principal

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Antonio Salas Ellacuriaga  

Co-Investigador Principal (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

José Gómez Rial

Sub-investigador (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Irene Rivero Calle  

Sub-investigador (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Lorenzo Redondo Collazo

Sub-investigador (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Ana Isabel Dacosta Urbieta

Sub-investigador (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Blanca Díaz Esteban

Sub-investigador (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Montserrat López Franco  

Sub-investigador (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Marta Lendoiro Fuentes

Sub-investigador (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Susana Rey García

Sub-investigator (Pneumology)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Luis Valdés Cuadrado

Sub-investigador (Neumología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Nuria Rodríguez Núñez

Sub-investigador (Neumología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Vanessa Riveiro Blanco

Sub-investigador (Neumología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Francisco Javier González Barcala  

Sub-investigador (Neumología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Antonio Pose Reino

Sub-investigador (Medicina interna)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Antonio Antela López

Sub-investigador (Medicina interna)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Pablo Varela García

Sub-investigador (Medicina interna)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

María Jesús Domínguez Santalla

Sub-investigador (Medicina interna)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

María Pazo Núñez

Sub-investigador (Medicina interna)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Cristobal Galbán Rodríguez

Sub-investigador (UCI)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Ana López Lago

Sub-investigador (UCI)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Elena Giráldez Vázquez

Sub-investigador (UCI)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Carmen Rivero Velasco

Sub-investigador (UCI)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Eva Saborido Paz

Sub-investigador (UCI)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

José Luis García Allut

Sub-investigador (UCI)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Juan Fernández Villaverde

Sub-investigador (UCI)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Beatriz Lence Massa

Sub-investigador (UCI)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Carla Saito Villanueva

Sub-investigador (UCI)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Manuel Taboada Muñiz

Sub-investigador (Anestesia y Reanimación)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Julian Álvarez Escudero

Sub-investigador (Anestesia y Reanimación)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Gloria Maria Prada Hervella

Sub-investigador (Anestesia y Reanimación)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Mª Luisa Pérez del Molino Bernal

Sub-investigador (Microbiología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Gema Barbeito Castiñeiras

Sub-investigador (Microbiología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Daniel Navarro De la Cruz

Sub-investigador (Microbiología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

José Javier Costa Alcalde

Sub-investigador (Microbiología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Antonio Aguilera Guirao

Sub-investigador (Microbiología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Amparo Coira Nieto

Sub-investigador (Microbiología)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Juan Bautista Ortolá Devesa

Sub-investigador (Laboratorio central)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Teresa QueiroVerdes

Sub-investigador (Medicina Preventiva)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Hugo Pérez Freixo

Sub-investigador (Medicina Preventiva)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Pablo Souto Sanmartín

Sub-investigador (Medicina Preventiva)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Mónica Conde Pájaro

Supervisora enfermería (Medicina Preventiva)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Beatriz Guerra Liñares

Enfermera (Medicina Preventiva)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Pilar Leborans Iglesias

Supervisora enfermería (Pediatría)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Eloína Núñez Masid

Gerente del Área Sanitaria de Santiago de Compostela e Barbanza

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Manuel Portela Romero

Subdirector de Prestación Farmacéutica, Formación, Docencia, Investigación e Innovación

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

María Victoria Carral García

Directora de Procesos de Enfermería

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Lidia Piñeiro Rodríguez

Enfermera (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Sara Rey Vázquez

Enfermera (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

José Miguel Sadiki Orayyou

Enfermera (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

María Soledad Vilas Iglesias

Enfermera (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Sonia Serén Fernández

Enfermera (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Luisa García Vicente

Enfermera (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Alberto Gómez Carballa

Personal de Laboratorio (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Jacobo Pardo Seco

Personal de Laboratorio (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Xabier Bello Paderne

Personal de Laboratorio (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

María José Currás Tuala

Personal de Laboratorio (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Sara Pischedda

Personal de Laboratorio (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Sandra Viz Lasheras

Personal de Laboratorio (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Miriam Ben García

Personal de Laboratorio (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Patricia Regueiro Casuso

Personal de Laboratorio (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Miriam Cebey López

Personal de Laboratorio (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Carmen Rodríguez-Tenreiro Sánchez

Coordinadora de investigación  (GENVIP)

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela

Laura  Moreno

Sub Investigador (GENDRES)

H.Materno  Infantil / Hospital Virgen del Camino

Susana  Beatriz Reyes

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  Virgen de la Arrixaca de Murcia

Sonia  Sanchiz

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  Virgen de la Arrixaca de Murcia

Mari  Cruz León

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  Virgen de la Arrixaca de Murcia

Cristina  Calvo

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  La Paz

Carlos Grasa

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  La Paz

María  Jesús Cabero

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  Valdecilla

Marta  Pareja

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  General de Albacete

Pablo  Rojo

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  12 Octubre

Cristina  Epalza

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  12 Octubre

Patricia  Flores Pérez

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  Niño Jesús

Raquel  Jiménez

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  Niño Jesús

Mª  Yolanda Ruíz del Prado

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  San Pedro de La Rioja

David  Moreno

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  Carlos Haya

Beatríz  Carazo

Sub Investigador (GENDRES)

Hospital  Carlos Haya